Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC48

Pex12, Peroxisome assembly protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex12Q8VC48 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pex12Q8VC48 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex12Q8VC48 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms