Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms