Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwnkQ8CIW5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwnkQ8CIW5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms