Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms