Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF93

Galnt13, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13, mousemouse

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt13Q8CF93 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Galnt13Q8CF93 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Galnt13Q8CF93 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Galnt13Q8CF93 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms