Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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