Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms