Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efemp1Q8BPB5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efemp1Q8BPB5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms