Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prox2Q8BII1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prox2Q8BII1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms