Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NanogQ80Z64 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NanogQ80Z64 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NanogQ80Z64 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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