Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms