Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcmf1Q80UY2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcmf1Q80UY2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms