Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr5Q80US4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr5Q80US4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms