Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms