Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms