Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms