Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms