Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed3Q78IS1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms