Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmeff1Q6PFE7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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