Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85bQ6PDY0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms