Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6PD19 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6PD19 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6PD19 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6PD19 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6PD19 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms