Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf6Q6NVF9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms