Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo27Q6DIA9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms