Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
N4bp1Q6A037 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
N4bp1Q6A037 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms