Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn3Q62471 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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