Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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