Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Laptm4aQ60961 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms