Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SkiQ60698 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms