Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsr1Q5SWD9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms