Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf3Q5HZG4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms