Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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