Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms