Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed1Q3V009 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed1Q3V009 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms