Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms