Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr1d1Q3UV55 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms