Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms