Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms