Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms