Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorlQ3U285 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms