Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcnjQ3TZI6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnjQ3TZI6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms