Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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