Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms