Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms