Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab42Q0PD08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab42Q0PD08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms