Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms