Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms