Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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