Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms