Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms