Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Muc1Q02496 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms